Заповедник "Столбы" был организован в 1925 году. Площадь территории заповедника 470 кв. км, геогафические координаты: 55 38 - 55 58 северной широты и 92 38 - 93 05 восточной долготы. Территория расположена вблизи пригородов Красноярска, в непосредственной близости к правому берегу Енисея, между его притоками - Базаиха, Мана и Большая Слизнева. Заповедник расположен на Куйсумском хребте Манского Белогорья в системе хребтов Восточного Саяна. Абсолютные отметки этого междуречья колеблются в пределах 200-800 м. Низкогорная часть от 200 до 500 м занимает 28.1% площади территории. Оставшаяся часть - это среднегорная часть (500 - 800м), где и выходят на поверхность сиентовые скалы, известные во всем мире.
Значительная часть территории находится от 500 метров до 700 метров (60.1%) над уровнем моря.